Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04212 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P04212 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04212 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04212 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04212 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04212 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04212 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04212 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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