Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa3P02831 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa3P02831 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa3P02831 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa3P02831 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxa3P02831 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms