Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms