Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01804 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01804 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01804 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01804 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01804 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01804 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01804 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01804 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01804 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01804 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01804 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01804 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01804 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01804 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01804 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01804 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01804 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms