Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01798 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01798 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01798 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01798 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01798 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01798 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01798 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms