Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01783 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01783 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01783 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01783 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01783 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01783 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01783 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01783 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01783 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01783 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01783 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01783 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01783 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01783 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01783 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01783 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01783 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01783 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01783 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01783 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01783 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01783 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01783 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01783 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01783 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01783 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01783 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01783 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms