Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igk-V19-17P01633 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Igk-V19-17P01633 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms