Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C4bP01029 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C4bP01029 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C4bP01029 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C4bP01029 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C4bP01029 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4bP01029 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4bP01029 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C4bP01029 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C4bP01029 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4bP01029 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4bP01029 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4bP01029 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4bP01029 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C4bP01029 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4bP01029 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4bP01029 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4bP01029 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4bP01029 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4bP01029 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4bP01029 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4bP01029 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4bP01029 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4bP01029 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4bP01029 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4bP01029 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4bP01029 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4bP01029 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4bP01029 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4bP01029 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4bP01029 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4bP01029 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms