Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sypl2O89104 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sypl2O89104 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms