Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp1O89090 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms