Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Setdb1O88974 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Setdb1O88974 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Setdb1O88974 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms