Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MscO88940 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MscO88940 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MscO88940 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MscO88940 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MscO88940 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MscO88940 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MscO88940 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MscO88940 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms