Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CcnkO88874 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CcnkO88874 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CcnkO88874 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CcnkO88874 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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