Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms