Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkcO88445 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms