Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme6O88425 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme6O88425 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms