Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vti1bO88384 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms