Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms