Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb5O55234 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms