Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms