Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt5hO55201 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms