Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms