Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap2O55126 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms