Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms