Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms