Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole2O54956 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms