Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk2a2O54833 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms