Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CrxO54751 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CrxO54751 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CrxO54751 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CrxO54751 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CrxO54751 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CrxO54751 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CrxO54751 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CrxO54751 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CrxO54751 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CrxO54751 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CrxO54751 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CrxO54751 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CrxO54751 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CrxO54751 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CrxO54751 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CrxO54751 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CrxO54751 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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