Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33bO35963 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms