Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pik3cdO35904 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pik3cdO35904 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms