Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms