Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NudcO35685 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NudcO35685 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NudcO35685 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NudcO35685 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NudcO35685 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NudcO35685 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NudcO35685 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NudcO35685 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NudcO35685 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NudcO35685 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NudcO35685 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NudcO35685 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NudcO35685 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NudcO35685 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms