Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema6aO35464 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms