Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccrl2O35457 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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