Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6bO35451 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms