Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms