Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad6O35182 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad6O35182 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smad6O35182 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smad6O35182 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms