Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ArxO35085 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ArxO35085 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ArxO35085 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ArxO35085 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ArxO35085 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms