Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbsnO08976 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PbsnO08976 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms