Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms