Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckarO08786 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckarO08786 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckarO08786 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckarO08786 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckarO08786 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms