Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp6O08738 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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