Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltaO08585 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltaO08585 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltaO08585 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltaO08585 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltaO08585 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltaO08585 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltaO08585 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CltaO08585 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltaO08585 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltaO08585 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltaO08585 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltaO08585 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CltaO08585 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltaO08585 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CltaO08585 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltaO08585 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltaO08585 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltaO08585 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltaO08585 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltaO08585 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltaO08585 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CltaO08585 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltaO08585 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltaO08585 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms