Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms