Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1oL7MU04 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms