Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms