Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5225J3QPL3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5225J3QPL3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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