Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim18J3QNP2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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