Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm21972J3QN38 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm21972J3QN38 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm21972J3QN38 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm21972J3QN38 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21972J3QN38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21972J3QN38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21972J3QN38 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21972J3QN38 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21972J3QN38 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm21972J3QN38 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm21972J3QN38 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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