Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700014D04RikJ3QMS2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms